43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1417 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1417  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
102 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.39 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.69 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.69 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0539  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.05 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.75 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2219  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.14 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000028084  hitchhiker  0.0000143295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.22 
 
 
90 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0121  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.67 
 
 
68 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 
71 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.548661  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.16 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.33 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.304767  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0245  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.36 
 
 
164 aa  47  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.59 
 
 
623 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.518316  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.38 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1949  hypothetical protein  36.99 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.573256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1952  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  27.66 
 
 
806 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0303  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.99 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0759911 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.14 
 
 
502 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.85 
 
 
368 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.62 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1711  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  40.62 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.99 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.44 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.88 
 
 
503 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.87 
 
 
355 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.44 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0370  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  33.78 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.426462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1540  hypothetical protein  36.36 
 
 
379 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  28.77 
 
 
509 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.25 
 
 
164 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  28.57 
 
 
505 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.77 
 
 
509 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3208  ferredoxin III, nif-specific  34.94 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.478664  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  34.52 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0208  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  32.88 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2698  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  40.38 
 
 
587 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.71 
 
 
314 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24680  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain G-like protein  33.33 
 
 
251 aa  40.8  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0826  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.93 
 
 
286 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2102  ferredoxin family protein  37.35 
 
 
87 aa  40  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>