39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3312 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 368 aa  756    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0121  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.59 
 
 		 149 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2219  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.08 
 
 		 95 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000028084  hitchhiker  0.0000143295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 90 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.43 
 
 		 68 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.1 
 
 		 94 aa  57.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.32 
 
 		 78 aa  57.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.304767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.548661  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.36 
 
 		 288 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 139 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 139 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 		 133 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1527  cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.34 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.181573  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1544  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.84 
 
 		 102 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  37.88 
 
 		 96 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.31 
 
 		 104 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0463  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  42.37 
 
 		 89 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0586  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  42.11 
 
 		 100 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.700199  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  35.59 
 
 		 64 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2172  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  41.07 
 
 		 88 aa  46.6  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1865  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.92 
 
 		 306 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.748281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0261  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  36.92 
 
 		 92 aa  46.2  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08380  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, gamma subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family/2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate family  35.59 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.198369  normal  0.196547 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  38.6 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  38.1 
 
 		 502 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1417  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 		 102 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  35.38 
 
 		 503 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1350  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.35 
 
 		 1480 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.933284 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18380  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.93 
 
 		 287 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.26924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0977  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.5 
 
 		 1105 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000028046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 		 282 aa  43.5  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1647  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  35.59 
 
 		 85 aa  43.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.467603  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0570  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  40 
 
 		 87 aa  43.1  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2793  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  38.98 
 
 		 97 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00379398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1923  2-oxoacid:acceptor oxidoreductase, delta subunit, pyruvate/2-ketoisovalerate  36.99 
 
 		 96 aa  42.7  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1234  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 281 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>