49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0539 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0539  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
123 aa  253  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.26 
 
 
139 aa  149  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  57.26 
 
 
139 aa  149  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 
133 aa  101  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.78 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1417  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.05 
 
 
102 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.45 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.94 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0121  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.84 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2219  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  37.04 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000028084  hitchhiker  0.0000143295 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.71 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0245  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.59 
 
 
164 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2534  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.666903  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2333  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.757399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2422  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2377  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2426  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3279  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.732887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2281  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2442  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02035  hypothetical protein  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1501  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1511  dihydroorotate dehydrogenase family protein  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.823928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02076  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0824  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.15 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.518316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2294  dihydropyrimidine dehydrogenase  38.57 
 
 
411 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00484206 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  36.59 
 
 
96 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.63 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.18 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1949  hypothetical protein  37.84 
 
 
93 aa  50.8  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.573256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.53 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0303  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.1 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0759911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  36 
 
 
432 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0370  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  34.18 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.426462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  44.26 
 
 
64 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0208  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  30.86 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.08 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.304767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  37.18 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1597  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.29 
 
 
607 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27430  4Fe-4S protein  31.94 
 
 
414 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3263  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31 
 
 
257 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0320677 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1897  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.82 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1711  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  31.4 
 
 
89 aa  40.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  38.89 
 
 
500 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 
368 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 
453 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0774  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.49 
 
 
394 aa  40  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>