28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5918 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5918  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0480  hypothetical protein  78.33 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1080  hypothetical protein  71.88 
 
 		 68 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0095  hypothetical protein  71.21 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.253511  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4456  hypothetical protein  67.19 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0976  hypothetical protein  67.19 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5094  protein of unknown function DUF683  67.19 
 
 		 68 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3541  hypothetical protein  60.94 
 
 		 65 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864487 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1563  protein of unknown function DUF683  62.12 
 
 		 69 aa  79.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  59.32 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1353  hypothetical protein  61.67 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3625  protein of unknown function DUF683  56.06 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2321  hypothetical protein  58.62 
 
 		 66 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7732  hypothetical protein  59.65 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1474  hypothetical protein  61.7 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909815  hitchhiker  0.000297198 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6220  hypothetical protein  48.48 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1231  protein of unknown function DUF683  50 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1513  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.266242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0237  hypothetical protein  49.02 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6874  hypothetical protein  38.33 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1820  protein of unknown function DUF683  40.32 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3936  hypothetical protein  36.51 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0231611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1792  protein of unknown function DUF683  40.32 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4800  protein of unknown function DUF683  39.66 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4254  hypothetical protein  39.34 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1346  hypothetical protein  38.1 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.780671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4481  hypothetical protein  42.31 
 
 		 88 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2112  protein of unknown function DUF683  39.66 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>