28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3541 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3541  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4456  hypothetical protein  73.85 
 
 
68 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5094  protein of unknown function DUF683  75.38 
 
 
68 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1080  hypothetical protein  72.31 
 
 
68 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  80.7 
 
 
179 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0976  hypothetical protein  69.23 
 
 
68 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3625  protein of unknown function DUF683  64.06 
 
 
66 aa  82.8  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1353  hypothetical protein  65 
 
 
66 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5918  hypothetical protein  60.94 
 
 
66 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315015  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0480  hypothetical protein  55.38 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0095  hypothetical protein  56.92 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.253511  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1563  protein of unknown function DUF683  57.81 
 
 
69 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6220  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2321  hypothetical protein  56.14 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251723  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7732  hypothetical protein  50.77 
 
 
72 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0237  hypothetical protein  50.91 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4800  protein of unknown function DUF683  46.67 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1346  hypothetical protein  45.9 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.780671  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1231  protein of unknown function DUF683  50.94 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1474  hypothetical protein  57.45 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909815  hitchhiker  0.000297198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1513  hypothetical protein  50.94 
 
 
87 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.266242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1792  protein of unknown function DUF683  45.16 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1820  protein of unknown function DUF683  45.16 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2112  protein of unknown function DUF683  48.28 
 
 
78 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4254  hypothetical protein  45.9 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6874  hypothetical protein  44.9 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3936  hypothetical protein  40.98 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0231611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4481  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>