28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4456 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4456  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5094  protein of unknown function DUF683  86.76 
 
 		 68 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1080  hypothetical protein  85.29 
 
 		 68 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0976  hypothetical protein  82.35 
 
 		 68 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3541  hypothetical protein  73.85 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5918  hypothetical protein  67.19 
 
 		 66 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  71.93 
 
 		 179 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0095  hypothetical protein  66.15 
 
 		 66 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.253511  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3625  protein of unknown function DUF683  67.19 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1353  hypothetical protein  64.52 
 
 		 66 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0480  hypothetical protein  61.67 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7732  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1563  protein of unknown function DUF683  57.81 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2321  hypothetical protein  57.89 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1474  hypothetical protein  61.7 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909815  hitchhiker  0.000297198 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6220  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1346  hypothetical protein  45.9 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.780671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4254  hypothetical protein  47.54 
 
 		 82 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0237  hypothetical protein  50.91 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1231  protein of unknown function DUF683  50 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000278631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1513  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.266242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4800  protein of unknown function DUF683  45.16 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6874  hypothetical protein  44 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3936  hypothetical protein  42.62 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0231611 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1792  protein of unknown function DUF683  40.32 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2112  protein of unknown function DUF683  43.1 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268898 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1820  protein of unknown function DUF683  40.32 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4481  hypothetical protein  48.78 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>