28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7732 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7732  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2321  hypothetical protein  76.19 
 
 
66 aa  94  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0251723  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1353  hypothetical protein  66.67 
 
 
66 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1474  hypothetical protein  85.11 
 
 
68 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909815  hitchhiker  0.000297198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4456  hypothetical protein  60 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0480  hypothetical protein  64.91 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0095  hypothetical protein  56.92 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.253511  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0976  hypothetical protein  60 
 
 
68 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1080  hypothetical protein  58.33 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0237  hypothetical protein  55.17 
 
 
63 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1513  hypothetical protein  50.77 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.266242  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1231  protein of unknown function DUF683  50.77 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5094  protein of unknown function DUF683  56.67 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3541  hypothetical protein  50.77 
 
 
65 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00864487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5918  hypothetical protein  59.65 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315015  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1563  protein of unknown function DUF683  53.97 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3989  ferredoxin III, nif-specific  51.72 
 
 
179 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0809121  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3625  protein of unknown function DUF683  47.62 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6874  hypothetical protein  50.98 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4481  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6220  hypothetical protein  40.98 
 
 
67 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1792  protein of unknown function DUF683  47.92 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1820  protein of unknown function DUF683  47.92 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2112  protein of unknown function DUF683  47.92 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4800  protein of unknown function DUF683  48.84 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1346  hypothetical protein  44.9 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.780671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3936  hypothetical protein  42.86 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0231611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4254  hypothetical protein  43.18 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>