29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2925 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  100 
 
 
227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  46.52 
 
 
230 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  44.98 
 
 
242 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  45.02 
 
 
231 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  45.02 
 
 
231 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  45.02 
 
 
231 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  45.37 
 
 
231 aa  181  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  28.82 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  25.81 
 
 
302 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  29.29 
 
 
241 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  26.16 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  28.57 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  27.94 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  26.89 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  27.94 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  26.97 
 
 
271 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2312  hypothetical protein  22.37 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  21.79 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  20.69 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  21.19 
 
 
257 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  20.69 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  21.61 
 
 
234 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5439  hypothetical protein  27.59 
 
 
376 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  21.79 
 
 
262 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0196  hypothetical protein  22.27 
 
 
268 aa  48.5  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122659 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  23.84 
 
 
253 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1788  hypothetical protein  23.01 
 
 
255 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0032  hypothetical protein  24.47 
 
 
340 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.095806  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  26.81 
 
 
250 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>