15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_2252 on replicon NC_010579
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  70.95 
 
 		 241 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  70.95 
 
 		 241 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  68.88 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  59.32 
 
 		 242 aa  315  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  51.88 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  48.52 
 
 		 271 aa  263  1e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  43.78 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  33.76 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  30.83 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  29.29 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  27.64 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  23.27 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  23.27 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  22.54 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>