20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6608 on replicon NC_008385
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  99.59 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  100 
 
 		 241 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  89.63 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  70.95 
 
 		 241 aa  378  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  63.56 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  56.07 
 
 		 240 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  48.52 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  46.78 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  31.65 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  31.69 
 
 		 268 aa  115  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  27.94 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  23.21 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  23.9 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  23.27 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58910  chromosome partitioning related protein  29.5 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000312998  normal  0.0159267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  23.9 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  23.9 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  24.5 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3210  chromosome segregation ATPase  52.5 
 
 		 255 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1862  ATPase  33.33 
 
 		 302 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.782865  normal  0.135282 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>