27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1729 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  99.57 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  58.15 
 
 		 242 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  55.75 
 
 		 231 aa  242  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  53.45 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  45.02 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  29.66 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  25.31 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2312  hypothetical protein  23.4 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  23.05 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  22.61 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  22.17 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  23.42 
 
 		 302 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  24.36 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  26.71 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1788  hypothetical protein  25.46 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  22.94 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  24.46 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5439  hypothetical protein  47.62 
 
 		 376 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  24.26 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6487  hypothetical protein  23.11 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  23.9 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  23.27 
 
 		 241 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  23.6 
 
 		 241 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  27.98 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  21.86 
 
 		 241 aa  42.4  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>