27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_24500 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  62.28 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  55.75 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  55.75 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  55.75 
 
 		 231 aa  265  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  48.25 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  45.37 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  29.96 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  25.85 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  23.9 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2312  hypothetical protein  23.89 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  22.47 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  25.5 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  22.37 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  22.37 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  22.37 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5439  hypothetical protein  24.83 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  22.03 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  26.03 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  26.45 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  26.45 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0196  hypothetical protein  24.31 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122659 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  26.12 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  23.36 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  23.32 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0032  hypothetical protein  22.59 
 
 		 340 aa  43.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.095806  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  25.1 
 
 		 234 aa  41.6  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>