20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2175 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  29.66 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  29.66 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  31.33 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  30.6 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  29.24 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  29.96 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5439  hypothetical protein  24.91 
 
 		 376 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765714 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  28.82 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  26.17 
 
 		 302 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0032  hypothetical protein  25.32 
 
 		 340 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.095806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  24.89 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  25.68 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  27.64 
 
 		 241 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  27.07 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  24.58 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  23.27 
 
 		 241 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  23.27 
 
 		 241 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6485  hypothetical protein  28.1 
 
 		 230 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.32535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  23.81 
 
 		 257 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>