17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0030 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  100 
 
 		 242 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  64.83 
 
 		 241 aa  338  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  63.56 
 
 		 241 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  63.56 
 
 		 241 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  59.32 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  51.72 
 
 		 240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  46.84 
 
 		 271 aa  244  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  46.15 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  35.98 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  30.49 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  26.89 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  24.58 
 
 		 234 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  52.27 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.85 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.84 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  22.76 
 
 		 230 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0143  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  42.86 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>