30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2956 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  55.26 
 
 		 242 aa  257  9e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  53.45 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  53.45 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  53.45 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  48.25 
 
 		 231 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  46.52 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  30.6 
 
 		 234 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  26.36 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  22.65 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  22.65 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  21.79 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  21.37 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2312  hypothetical protein  21.03 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  20.51 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  30.15 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5439  hypothetical protein  23.86 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765714 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  24.89 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0031  hypothetical protein  22.97 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0569567  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  23.62 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3229  hypothetical protein  27.27 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.591613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  22 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  23.63 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  23.21 
 
 		 241 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0032  hypothetical protein  23.28 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.095806  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  22.78 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0196  hypothetical protein  21.83 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122659 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6487  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  22.76 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1788  hypothetical protein  24.88 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>