15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_A0048 on replicon NC_011148
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  100 
 
 		 268 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  49.39 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  36.29 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  30.49 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  31.51 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  31.02 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  30.83 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  31.69 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  31.25 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  31.69 
 
 		 241 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  30.15 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  26.71 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  26.71 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  26.71 
 
 		 231 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  21.61 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>