15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4210 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  98.81 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  93 
 
 		 257 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  93.83 
 
 		 262 aa  473  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  89.47 
 
 		 252 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2312  hypothetical protein  88.16 
 
 		 253 aa  454  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6600  hypothetical protein  43.7 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  23.81 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  22.65 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  24.46 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  24.46 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  24.46 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3236  hypothetical protein  26.27 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  19.33 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  23.81 
 
 		 234 aa  42  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>