14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2312 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2312  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0886961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  88.16 
 
 		 257 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  85.55 
 
 		 256 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  85.99 
 
 		 257 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  87.55 
 
 		 262 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  81.35 
 
 		 252 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6600  hypothetical protein  42.02 
 
 		 217 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  23.58 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  21.03 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  23.4 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  23.4 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  23.4 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3236  hypothetical protein  27.03 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  21.4 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>