26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0197 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0032  hypothetical protein  39.69 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.095806  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1788  hypothetical protein  26.46 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  26.36 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0196  hypothetical protein  28.1 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  26.17 
 
 		 234 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  23.67 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6487  hypothetical protein  24.6 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  21.34 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  23.42 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  23.42 
 
 		 231 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0031  hypothetical protein  23.53 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0569567  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  23.42 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  24 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  21.01 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  19.65 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3545  hypothetical protein  20.94 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.928793  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2574  hypothetical protein  28.31 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2492  hypothetical protein  24.42 
 
 		 252 aa  45.8  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3229  hypothetical protein  20.51 
 
 		 296 aa  45.8  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.591613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4210  hypothetical protein  19.33 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4315  hypothetical protein  19.33 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4987  hypothetical protein  19.75 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0474  hypothetical protein  25.29 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.772079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.2 
 
 		 425 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.162956  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0205  putative partitioning protein ParA  25.53 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>