12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1788 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1788  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6487  hypothetical protein  38.49 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  26.46 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  25.46 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  25.46 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  25.46 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0031  hypothetical protein  24.9 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0569567  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3235  hypothetical protein  23.24 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0196  hypothetical protein  26.05 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00122659 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0032  hypothetical protein  25.55 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.095806  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4378  hypothetical protein  21.83 
 
 		 262 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  0.0281259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  24.88 
 
 		 230 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>