15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0474 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0474  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.772079 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0238  hypothetical protein  95.3 
 
 		 234 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6485  hypothetical protein  83.48 
 
 		 230 aa  370  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.32535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1779  hypothetical protein  69.06 
 
 		 230 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2574  hypothetical protein  65.5 
 
 		 230 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0197  hypothetical protein  27.55 
 
 		 302 aa  62  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393973 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4985  hypothetical protein  26.25 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  25.11 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  25.59 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  27.27 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  27.27 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  27.27 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0337  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.13 
 
 		 300 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.0000000110722  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  25.81 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1733  chromosome partitioning ATPase  29.82 
 
 		 419 aa  41.6  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.635765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>