16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_A0040 on replicon NC_011351
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  49.39 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  38.02 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  35.98 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  32.78 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  32.77 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  33.76 
 
 		 241 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  32.49 
 
 		 241 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  31.65 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  31.65 
 
 		 241 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  25.31 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  25.31 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  25.31 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5228  hypothetical protein  28.24 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.231846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  19.6 
 
 		 242 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  23.62 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>