15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_5052 on replicon NC_008771
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  100 
 
 		 250 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  52.12 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  48.93 
 
 		 241 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  46.78 
 
 		 241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  46.78 
 
 		 241 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  46.15 
 
 		 242 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  43.78 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  44.68 
 
 		 240 aa  221  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  38.02 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  36.29 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  30 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  27.98 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  27.98 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02155  Cytosolic Fe-S cluster assembling factor nbp35 (Nucleotide-binding protein 35) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBC5]  38.6 
 
 		 341 aa  42  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>