19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_3067 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_3067  transfer origin protein, TraL  100 
 
 		 271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2252  conjugal transfer protein TraL  48.52 
 
 		 241 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4311  conjugal transfer protein TraL  48.95 
 
 		 241 aa  261  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5052  transfer origin protein, TraL  52.12 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6529  conjugal transfer protein TraL  48.52 
 
 		 241 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457087  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6608  conjugal transfer protein TraL  48.52 
 
 		 241 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0030  conjugal transfer protein TraL  46.84 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.98281e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4674  conjugal transfer protein TraL  47.01 
 
 		 240 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0040  TraL  32.78 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0136277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0048  TraL  31.51 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0426  putative mobilization protein MobD  29.71 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2956  putative mobilization protein MobD  22 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2925  putative mobilization protein MobD  26.97 
 
 		 227 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.277225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2364  putative mobilization protein MobD  24.26 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2341  hypothetical protein  24.26 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1729  hypothetical protein  24.26 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2175  mobilization protein MobD-like  24.89 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0519268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24500  hypothetical protein  25.5 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.109937  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0038  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.24 
 
 		 260 aa  42  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>