40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2878 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  35.58 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  35.58 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  35.58 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  35.58 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  37.62 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  36.89 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  37.25 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  28.3 
 
 
103 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  34 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  36.89 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  36.89 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  27.72 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  39.08 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  34.09 
 
 
135 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  29.59 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  29.59 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  32.93 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  29.67 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  34.74 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  34.74 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  34.74 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  33.68 
 
 
128 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  31.58 
 
 
114 aa  47.4  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  30.85 
 
 
128 aa  47  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  27.37 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  30.86 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  36.78 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  27.71 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  27.91 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  33.68 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  27.55 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  33.68 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  33.68 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  33.68 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  28.21 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1948  ATP-dependent RNA helicase HrpA  34.55 
 
 
1300 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>