25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1433 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  264  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  99.22 
 
 
128 aa  263  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  92.19 
 
 
128 aa  246  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  91.41 
 
 
128 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  91.41 
 
 
128 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  91.41 
 
 
128 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  75 
 
 
129 aa  209  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  72.66 
 
 
128 aa  208  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  71.09 
 
 
129 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  68.75 
 
 
128 aa  200  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  90.62 
 
 
128 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  72.09 
 
 
129 aa  190  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  74.31 
 
 
129 aa  181  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  70.91 
 
 
131 aa  179  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  29.55 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  34.02 
 
 
99 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  29.17 
 
 
101 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  32.99 
 
 
100 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  27.84 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  32.65 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  23.71 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  26.88 
 
 
117 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  31.58 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>