28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1259 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  269  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  73.44 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  209  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  73.44 
 
 		 129 aa  203  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  67.19 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  75.78 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  75.78 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  75.78 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  67.19 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  74.31 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  63.57 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  68.81 
 
 		 131 aa  173  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  74.22 
 
 		 128 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  34.09 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  29.59 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  30.93 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  30.53 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  25.77 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  29.9 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  28.89 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  26.17 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  25.77 
 
 		 107 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>