16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1366 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  234  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  60.75 
 
 
107 aa  142  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  41.03 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  36.36 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  36.26 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  30.77 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  34.57 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  32.98 
 
 
108 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  36.78 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  40.66 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  32.32 
 
 
128 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  35.8 
 
 
117 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  31.31 
 
 
128 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  35.11 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  28.05 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  29.21 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>