32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0674 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  213  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  47.83 
 
 
117 aa  76.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  37.23 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  46.6 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  43.37 
 
 
114 aa  70.9  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  47.44 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  41.57 
 
 
113 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  34.88 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  35.11 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  35.48 
 
 
130 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  35.48 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  34.41 
 
 
130 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  34.41 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  32.58 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  35.62 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  34.02 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  32.93 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  34.25 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  34.44 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  33.68 
 
 
107 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  31.52 
 
 
113 aa  45.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  35.44 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  27.37 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
106 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  34.92 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  34.92 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  34.92 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  31.31 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  29.03 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>