26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5407 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  271  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  98.46 
 
 		 130 aa  268  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  98.46 
 
 		 132 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  96.15 
 
 		 130 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  68.38 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  73.85 
 
 		 130 aa  193  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  72.31 
 
 		 130 aa  190  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  56.69 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  51.15 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  46.21 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  45.8 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  34.95 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  39.02 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  36.26 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  30.39 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  31.76 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  33.65 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  30.3 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  35.62 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  28.71 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  28.28 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  34.02 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  25.74 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>