35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0710 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  213  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  55.21 
 
 		 99 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  56.25 
 
 		 100 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  38.95 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  42.68 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  38.61 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  32.65 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  37 
 
 		 101 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  30.3 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  30.3 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  30.3 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  30.53 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  32.65 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  32.65 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  36 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  32.65 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  32.65 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  29.47 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  29.47 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  29.47 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  30.53 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  36 
 
 		 130 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  28.42 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  30 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  27.88 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  35.44 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  28.57 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  31 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  26.32 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  30.23 
 
 		 104 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  30.49 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  27.96 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>