26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5522 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  96.92 
 
 		 130 aa  235  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  72.31 
 
 		 130 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  73.08 
 
 		 132 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  73.08 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  73.44 
 
 		 130 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  64.71 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  55.3 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  49.61 
 
 		 131 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  53.79 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  54.2 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  35.92 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  40.96 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  37.65 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  31.37 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  30.39 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  30.95 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  28.83 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  28.71 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  30.93 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  34.25 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  29 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  25.25 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  25.77 
 
 		 100 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>