29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0407 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  208  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  70.71 
 
 		 99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  56.25 
 
 		 102 aa  113  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  43.9 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  38.14 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  34.02 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  34.02 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  34.02 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  32.99 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  28.28 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  29 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  30.21 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  27.27 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  27.27 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  31.76 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  25.77 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>