33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3187 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  214  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  47 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  34.38 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  39 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  37 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  31.25 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  34.38 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  30.21 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  30.21 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  30.21 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  30.21 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  29.59 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  29.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  28.12 
 
 		 128 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  32.22 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  28.12 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  27.55 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  30.49 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  27.88 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  25.74 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  25.74 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  27.18 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  25.74 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  27.71 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  29 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  26.47 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  26 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>