27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1543 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  5e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  69.53 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  200  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  67.97 
 
 		 128 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  67.19 
 
 		 128 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  68.75 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  64.84 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  60.94 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  69.53 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  54.26 
 
 		 129 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  62.62 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  64.49 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  38.14 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  37.25 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  31.25 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  30.21 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  27.84 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  32.95 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  34.52 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  30 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  32.81 
 
 		 106 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>