32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2341 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  47.31 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  44.44 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  30.7 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  31.18 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  28.07 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  28.07 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  28.07 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  28.07 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  29.82 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  28.83 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  28.83 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  28.83 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  27.19 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  37.78 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  32.98 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  30.11 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  37.5 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  36.27 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  31.18 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  34.52 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  30.11 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  38.27 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  32.98 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  33.71 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  29.03 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  35.62 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  26.44 
 
 		 128 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  32.22 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  29.47 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>