40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0686 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  237  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  49.45 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  47.56 
 
 
114 aa  76.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  44.21 
 
 
117 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  42.57 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  43.68 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  43.42 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  35.51 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  35.48 
 
 
108 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  38.54 
 
 
103 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  34.02 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  34.02 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  30.93 
 
 
128 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  32.99 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  32.99 
 
 
130 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  37.97 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  31.86 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  34.02 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  31.86 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  38.36 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  30.93 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  36.99 
 
 
130 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  27.43 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  33.04 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  27.93 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  30.86 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  33.7 
 
 
113 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  26.92 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  27 
 
 
102 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  34.25 
 
 
135 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>