26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1102 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  48.89 
 
 		 113 aa  90.5  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  44.9 
 
 		 119 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  43.37 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  37.63 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  37.63 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  36.56 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  36.56 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  42.47 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  41.1 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  35.63 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  33.71 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  43.88 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  33.06 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  36.08 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  35.79 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  32.98 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  38.14 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  30.86 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  41.1 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  38.27 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  41.1 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  31.31 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  27.78 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>