13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1389 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  232  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  38.83 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  30.63 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  26.04 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  32.67 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  28.24 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  29.52 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  29.52 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  29.52 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  30.77 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  34.09 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  32.1 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>