28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5651 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  68.38 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  69.63 
 
 		 130 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  69.12 
 
 		 132 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  69.12 
 
 		 130 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  66.18 
 
 		 130 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  64.71 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  58.7 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  51.91 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  49.26 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  48.91 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  37.08 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  27.72 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  28.85 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  32.93 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  30.63 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  27.27 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  29.41 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  30.59 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  32.88 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  24.75 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  32.58 
 
 		 117 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  25.77 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  30.93 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  30.93 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  26 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  21.21 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>