31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4530 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  51.91 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  58.62 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  51.15 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  51.15 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  51.15 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  51.15 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  51.94 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  49.61 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  50.38 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  35.64 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  39.33 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  30.39 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  34.26 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  29.47 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  28.16 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  32.29 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  35.9 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  32.67 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  27.18 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  39.02 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  27.88 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  30.59 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  40 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  26.17 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>