27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1930 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  213  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 106 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  36.89 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  32.35 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  40.48 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  35.29 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  35.42 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  34.83 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  34.31 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  36.89 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  37.93 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  39.02 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  39.74 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  35.92 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  35.92 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  32.99 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  34.94 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  37.11 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  26.21 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  31.58 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  25.77 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  28.87 
 
 		 128 aa  40.4  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  27.84 
 
 		 128 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>