21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1110 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  223  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  30.77 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  38.96 
 
 
119 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  30.39 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  30.39 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  30.39 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  30.39 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  31.63 
 
 
135 aa  58.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  30.39 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  28.85 
 
 
137 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  35.14 
 
 
114 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  37.33 
 
 
106 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  26.04 
 
 
103 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  35.48 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  31.33 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  32.5 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  28.95 
 
 
166 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  28.95 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  28.57 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>