39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72770 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  337  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  98.52 
 
 		 135 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  56.06 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  48.91 
 
 		 137 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  53.79 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  46.21 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  46.21 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  45.52 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  46.21 
 
 		 130 aa  121  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  54.87 
 
 		 135 aa  120  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  40.78 
 
 		 103 aa  87.4  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  36.05 
 
 		 119 aa  67.4  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  38.89 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  33.98 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  63.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  40.24 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  32.99 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  37.84 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1110  hypothetical protein  27.66 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  31 
 
 		 101 aa  52.4  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00435  hypothetical protein  30.68 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.237328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  29 
 
 		 100 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1366  hypothetical protein  35.53 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  28 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  27.37 
 
 		 128 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1389  hypothetical protein  30.93 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  35.8 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  27.37 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  27.37 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  27.37 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  32.26 
 
 		 121 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  41.6  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  25 
 
 		 99 aa  40.8  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  26.32 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>