22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0680 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0680  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 106 aa  216  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0200863  unclonable  0.0000000130101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1930  hypothetical protein  34.62 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.235435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5651  hypothetical protein  32.67 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150791 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5407  hypothetical protein  31.73 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.047363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6317  hypothetical protein  41.35 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.776972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  32.29 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.425471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5358  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.934652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5266  hypothetical protein  30.77 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.452757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01750  hypothetical protein  36.26 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72770  hypothetical protein  40.38 
 
 		 166 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.610555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3498  hypothetical protein  30 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.559962  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1102  hypothetical protein  39.47 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0386613  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2734  hypothetical protein  27.72 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.936929  normal  0.72383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2878  hypothetical protein  31.03 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.54002  normal  0.288246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1671  hypothetical protein  35.59 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  30.3 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5071  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  37.31 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5522  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0674  hypothetical protein  35.29 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  28 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>