26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1336 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1336  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  266  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1469  hypothetical protein  92.19 
 
 		 128 aa  246  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0253681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1433  hypothetical protein  92.19 
 
 		 128 aa  246  8e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1439  hypothetical protein  92.19 
 
 		 128 aa  246  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2914  hypothetical protein  91.41 
 
 		 128 aa  246  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0257108  normal  0.856074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2653  hypothetical protein  92.97 
 
 		 128 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2720  hypothetical protein  92.97 
 
 		 128 aa  228  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2827  hypothetical protein  92.97 
 
 		 128 aa  228  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3172  hypothetical protein  77.34 
 
 		 129 aa  215  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.87367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3292  hypothetical protein  75 
 
 		 129 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.918096  hitchhiker  0.0000025592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1259  hypothetical protein  73.44 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.44122  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1617  hypothetical protein  91.41 
 
 		 128 aa  207  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1543  hypothetical protein  69.53 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1128  hypothetical protein  74.42 
 
 		 129 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2894  hypothetical protein  70.77 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0780795  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2646  hypothetical protein  75.23 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.995481 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3187  hypothetical protein  30.21 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.207132  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0832  hypothetical protein  30.68 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.191887  normal  0.109117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002739  hypothetical protein  32.99 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0446734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0407  hypothetical protein  32.99 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.135299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03040  hypothetical protein  27.37 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3652  hypothetical protein  23.71 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0710  hypothetical protein  28.42 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0890579  normal  0.814866 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2341  hypothetical protein  26.67 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>