33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2700 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  324  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  60 
 
 
170 aa  195  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  53.02 
 
 
152 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  47.97 
 
 
153 aa  153  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  46.62 
 
 
152 aa  143  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  43.14 
 
 
153 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  44.59 
 
 
159 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  45.39 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  45.67 
 
 
159 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  41.67 
 
 
154 aa  120  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  36.6 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  36.55 
 
 
157 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  45.95 
 
 
156 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  38.93 
 
 
153 aa  115  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  38.78 
 
 
155 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  39.39 
 
 
143 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  32.05 
 
 
176 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  35.62 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  31.94 
 
 
155 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  34.21 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  35.1 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  35.1 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  29.14 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  26.28 
 
 
207 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  27.86 
 
 
187 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  31.58 
 
 
272 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  29.76 
 
 
263 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  27.78 
 
 
253 aa  50.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  35.87 
 
 
256 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  36.67 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  42.5 
 
 
268 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1263  hypothetical protein  40.3 
 
 
295 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>