29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0544 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  421  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  87.17 
 
 		 187 aa  323  9e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  60.4 
 
 		 156 aa  151  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  34.84 
 
 		 153 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  31.01 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  28.18 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  51.61 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  45.07 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  33.33 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  37.14 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  27.11 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  26.97 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  30.2 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  31.25 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  25.77 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  28.21 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  29.19 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  25.77 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  26.28 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  31.51 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  35.53 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  39.34 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  25.62 
 
 		 156 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  24.24 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  33.85 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  37.7 
 
 		 249 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  29.58 
 
 		 272 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>