31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3792 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  51.3 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  47.41 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  45.95 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  47.48 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  43.05 
 
 		 170 aa  130  9e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  41.96 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  50.44 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  38.62 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  39.86 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  38.19 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  40.58 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  43.7 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  41.1 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  30.82 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  37.23 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  38.67 
 
 		 164 aa  98.2  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  35.62 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  32.45 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  32.45 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  30.82 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  34.29 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  26.42 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  27.67 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  26.57 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  35.82 
 
 		 263 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  41.82 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  34.67 
 
 		 256 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  27.4 
 
 		 272 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  23.78 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>