33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0117 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  51.95 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  52.52 
 
 		 211 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  54.55 
 
 		 170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  55.07 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  51.08 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  42.86 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  49.64 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  53.28 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  47.48 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  45.71 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  36.55 
 
 		 162 aa  118  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  44.44 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  39.07 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  45.65 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  32.19 
 
 		 176 aa  90.9  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  41.91 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  27.45 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  38.85 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  33.81 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  33.81 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  33.81 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  34.01 
 
 		 249 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  30.67 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  51.61 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  34.29 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  40 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  38.71 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  30.14 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  50 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2492  hypothetical protein  31.88 
 
 		 159 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>